1、看体色。孔雀鱼母鱼的体色也不及公鱼鲜艳。公鱼身上的鳍很大，体色漂亮，有很多花纹。而母鱼的鳍短小，体色单一，没有绚丽的花纹。
2、看尾巴。公鱼的尾巴比较大，而母鱼的尾巴较小。成体公鱼体长约3厘米，身体短，尾部长，占体长的三分之二左右。成体母鱼体长可达5-6厘米，身体长，尾鳍短，尾部约占体长的二分之一以上，且尾巴上都是黑色的。
3、看鳍部。孔雀鱼公鱼的臀鳍是长棒形，母鱼臀鳍则是扇形的。公鱼的腹鳍细长，鳍尖有个小钩；而母鱼的腹鳍比较宽大且短。此外公鱼的臀鳍演变出交接器，用于繁殖时输送精子用，因此公鱼的臀鳍前方的几根鳍条比较粗大，而雌鱼的臀鳍则是均匀的。
4、看胎斑。孔雀鱼母鱼有胎斑，而公鱼没有。公鱼全身都是漂亮的花纹，因此看不到腹腔内的内脏，而母鱼身体偏透明，若怀孕，其肛门处即会出现黑斑，胎斑越大则越接近生产。
