1、微波食品产生致癌化合物。曾有研究表明，微波过的肉类会产生致癌物；牛奶、水果、麦片中的氨基酸也会在微波后转化为致癌物；蔬菜中的植物生物碱同样会在微波后转化成致癌物危害我们健康。
2、食物营养严重流失。经过微波炉加热后，食物中的矿物质、维生素、生化酶等大量流失；另外食物在经过微波加热后，还会使得食物的口感变差；
3、易产生用电事故。在加热过程中不小心碰到，烫伤程度会比普通开水烫伤更严重；如果放入炉内的铁、铝、不锈钢、搪瓷等金属器皿，微波炉在加热时会与之产生电火花并反射微波，既损伤炉体又做不熟食物，严重的还容易引发火灾。
